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    研究・研究者

    奥村 久士

    おくむら ひさし / OKUMURA, Hisashi

    准教授

    TEL: 0564-59-5213
    E-Mail : hokumura_at_ims.ac.jp（_at_ は@に置き換えて下さい）
    場所：山手キャンパス　2号館2階東

    所属研究室 >

    所属

    生命創成探究センター　創成研究領域　生命分子動態シミュレーション研究グループ
    理論・計算分子科学研究領域　計算分子科学研究部門（兼）
    計算科学研究センター（兼）

    略歴

    1998年　慶應義塾大学理工学部卒業
    2000年　慶應義塾大学大学院理工学研究科物理学専攻 博士前期課程修了
    2002年　慶應義塾大学大学院理工学研究科基礎理工学専攻 博士後期課程修了 博士（理学）
    2002年　東京大学工学系研究科　日本学術振興会特別研究員（ＰＤ）
    2002年　分子科学研究所 助手
    2004年　総合研究大学院大学 助手（併任）
    2006年　名古屋大学理学研究科 COE特任講師
    2008年　米国ラトガース大学 研究助手
    2009年　米国ラトガース大学 研究助教授
    2009年　分子科学研究所　准教授
              　 総合研究大学院大学　准教授
    2018年　生命創成探究センター　准教授

    主な研究テーマ

    生体分子動力学シミュレーション：タンパク質の折りたたみ、変性、凝集、アミロイド線維
    キーワード 分子動力学シミュレーション、拡張アンサンブル法、タンパク質
    PDF Annual Review : PDF

    代表的な論文・著書

    1. S. G. Itoh, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, and H. Okumura: “Key residue for aggregation of amyloid-β peptides”, ACS Chem. Neurosci. 13, 3139–3151 (2022).
    2. H. Okumura, S. G. Itoh, K. Nakamura, and T. Kawasaki: “Role of water molecules in the laser-induced disruption of amyloid fibrils observed by nonequilibrium molecular dynamics simulations”, J. Phys. Chem. B 125, 4964–4976 (2021).
    3. H. Okumura and S. G. Itoh, “Amyloid fibril disruption by ultrasonic cavitation: Nonequilibrium molecular dynamics simulations,” J. Am. Chem. Soc. 136, 10549–10552 (2014).
    4. S. G. Itoh and H. Okumura: “Replica-permutation method with the Suwa-Todo algorithm beyond the replica-exchange method”, J. Chem. Theory Comput. 9, 570–581 (2013).
    受賞一覧 国際連携

    関連リンク

    マテリアル先端リサーチインフラ（ARIM）
    大学連携研究設備ネットワーク
    TILAコンソーシアム