分子研では現在、他機関と共同で以下のプロジェクトを推進しています。
ムーンショット型研究開発事業(内閣府)
ムーンショット目標6「2050年までに、経済・産業・安全保障を飛躍的に発展させる誤り耐性型汎用量子コンピュータを実現」の研究開発プログラム「大規模・高コヒーレンスな動的原子アレー型・誤り耐性量子コンピュータ」
光・量子飛躍フラッグシッププログラム Q-LEAP(文部科学省)
マテリアル先端リサーチインフラ事業(文部科学省)
大学連携研究設備ネットワーク(旧・化学系研究設備有効活用ネットワーク)